近期,中国科学院上海应用物理研究所与华东师范大学合作,在DNA分子机器方面取得新进展,构建了一种核酸外切酶驱动的高效DNA行走机器人。相关结果发表在Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 1855。
细胞内许多功能的实现和宏观世界中的机器运转有异曲同工之妙,这些自然界的分子机器由经过亿万年进化产生的生物大分子构成。而在试管中模拟细胞内的动态有序结构,构筑人工分子机器则引起了研究者的广泛兴趣。2016年诺贝尔化学奖即授予“分子机器的设计和合成”。DNA分子具有强大的序列可编程性及精确的分子识别能力,被认为是设计分子机器的重要元件。设计并构建高效率的DNA分子机器,在药物运输治疗、DNA并行计算和生物传感检测等领域具有重要的应用潜力。然而,以往合成的DNA分子机器可持续巡航能力往往比较低。针对这一技术难点,物理生物学研究室樊春海研究员与华东师范大学裴昊教授等合作,构建了一种核酸外切酶驱动的高效DNA行走机器人。他们发现通过调控DNA分子在金纳米粒子表面上的构象、密度和取向,可以显著改变酶分子与DNA之间的相互作用力。在此基础上,通过调控纳米界面上的 DNA 分子的空间排布,设计出一种可实现DNA分子在金纳米粒子表面自发运动行走的分子机器。这种分子机器的运行机制还可应用于发展信号放大策略,实现对DNA杂交过程的高灵敏检测。这一研究为设计新的智能诊疗器件及分子计算机提供了新的原理和策略。(物理生物学研究室 供稿)